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南通大學附屬醫院由清末狀元張謇先生創建于1911年，是一所省屬綜合性教學醫院，是江蘇省衛健委認定的具有區域影響力的長三角北翼和沿海經濟帶高水平醫療服務高地，同時也是高水平省級綜合類醫療中心。1994年被衛生部首批評定為三級甲等綜合性醫院，1998年被確定為國際緊急救援中心網絡醫院。醫院實際開放床位2149張，占地面積9.7萬平方米，建筑面積23.8萬平方米。2019年總診療人次233.6萬，出院病人12.2萬人次，住院手術5.5萬臺。現有職工3100多名，其中正高級職稱270余人，副高級職稱450余人，享受國務院特殊津貼專家24人，博士生、碩士生導師205余人。

近年來，醫院確立了以醫療為中心、以科技創新和人才培養為兩翼的“一體兩翼、強體健翼”發展戰略，緊跟醫藥衛生體制改革形勢，以綜合目標管理責任制考核指標為抓手，扎實推進“醫療服務品牌建設工程”，堅持公立醫院的辦院方向，認真落實發展任務，不斷加強基礎管理，統籌推進學科建設、人才培養、技術進步，醫療質量與安全持續改進，科教興院成效顯著，黨建與廉政行風建設扎實有效，醫院文化特色鮮明。

臨床醫學為江蘇省重點學科、博士學位授權一級學科，ESI排名躋身全球前1%，且排名不斷前移。醫院手外科為江蘇省臨床醫學研究中心；神經疾病診療中心為江蘇省“科教強衛工程”十大“臨床醫學中心”之一，手外科、醫學檢驗科、血液科、眼科為省“科教強衛工程”醫學重點學科；普外科、骨科、眼科、消化內科、血液內科、醫學檢驗科、心血管內科、神經內科、皮膚科、腎臟內科、呼吸內科、婦產科、神經外科、急診醫學科、醫學影像科、耳鼻咽喉科、心胸外科、整形外科、重癥醫學科、風濕免疫科、康復科、兒科、病理科、麻醉科、腫瘤科、泌尿外科等26個專科為省級臨床重點專科。醫院首批通過國家衛計委干細胞臨床研究機構認證，是國家高級卒中中心、中國胸痛中心、心衰中心、房顫中心、國家腦防委心源性卒中防治基地建設單位、江蘇省孕產婦危急重癥救治指導中心、江蘇省新生兒危急重癥救治中心和江蘇省創傷救治中心。醫院先后建成國家級博士后科研工作站、博士后科研流動站。擁有省“333工程”人才45人次；省特聘醫學專家4人；省“科教強衛工程”醫學創新團隊2個，醫學重點人才2人；省“六大人才高峰”項目資助85人。現任國家級學會專科分會、專業學組委員及以上職務463人次，其中中華醫學會骨科分會副主任委員（兼中國醫師協會骨科醫師分會副會長）1人，省級學會副會長、專科分會副主任委員及以上職務136人次，其中省醫學會占32次，省醫學會專科分會主任委員4名，候任主任委員4名。

醫院先后榮獲全國改善醫療服務創新醫院獎、全國衛生系統先進集體、全國醫院管理年活動先進單位、全國醫院文化建設先進單位、全國醫院法制建設先進單位、全國紀檢監察糾風工作先進集體、全國模范職工之家、全國醫藥衛生系統創先爭優活動先進集體、省衛生系統先進集體、省醫院管理年活動先進單位、省、市文明單位、省衛生系統先進黨組織、市民主評議政風行風先進單位、市“無紅包醫院”創建工作先進集體等榮譽。